ここまで、SQL Serverの基本機能を説明してきましたが、実際にはこれらを設定・管理するツールが必要となります。SQL Serverではこれらの管理ツールとして「SQL Server Management Studio」が用意されています。SQL Server Management Studioは、これまで説明してきた機能をGUIベースで設定できるツールで、日々のメンテナンスはもちろん、障害発生時の問題処理、復旧作業、また障害対策などのあらゆる設定をこのツールから行うことができます。
他のデータベースソフトでは、GUIツールがなかったり、設定する内容によっていくつものツールを利用しなければならなかったり、操作がわかりづらいなどの問題があります。しかしSQL Serverでは、基本的に管理ツールはこのSQL Server Management Studioに集約されており、操作面でもウィザードなどが多く採用されていたりと、わかりやすさや運用のしやすさなどが重視されている優れたツールとなっています。